Ειδογένεση είναι η διαδικασία κατά την οποία δημιουργείται ένα νέο είδος λόγω των περιβαλλοντικών συνθηκών σε μια δεδομένη στιγμή. Κινητήριος δύναμη της ειδογένεσης είναι η εξέλιξη. Στόχος της εξελικτικής διαδικασίας είναι το δημιουργούμενο είδος να είναι το πιο αρμοστό στις εκάστοτε συνθήκες του περιβάλλοντος.

Μια θεωρία που προσπαθεί να εξηγήσει την προέλευση των πλαστιδίων των φυτών, όπως είναι οι χλωροπλάστες και τα μιτοχόνδρια.