Οι κατηγορίες των ενζύμων σύνφωνα με την αντίδραση που καταλύουν είναι:
- Οξειγοαναγωγάσες: καταλύουν οξειδοαναγωγικές αντιδράσεις
- Τρανσφεράσες: καταλύουν μεταφορά ομάδας
- Υδρολάσες: καταλύουν διάσπαση δεσμών με παρεμβολή νερού
- Λυάσες: καταλύουν διάσπαση δεσμών χωρίς την παρεμβολή νερού
- Ισομεράσες: καταλύουν αντιδράσεις ισομερίωσης
- Λιγάσες: καταλύουν των σχηματισμό δεσμών με ταυτόχρονη υδρόλυση
Ονοματολογία
Τα συστημικά ονόματα των ενζύμων φανερώνουν και τη φύση της αντίδρασης που καταλύουν. Έτσι το θέμα του ονόματος παίρνει το όνομα του υποστρώματος που καταλύεται ή των υποστρωμάτων αν είναι διμοριακή αντίδραση, ενωμένων με δίστιγμο και η κατάληξη είναι σε -άση. Για ιστορικούς λόγους κάποια πρωετολυτικά ένζυμα κρατούν την κατάληξη -ίνη.
Τα κοινά ονόματα μοιάζουν με τα συστημικά αλλά φέρουν λιγότερη πληροφορία.
