Η λοίμωξη από τον ιό Epstein-Barr (EBV) έχει συσχετιστεί επιδημιολογικά με τον ερυθηματώδη λύκο, ωστόσο ο ρόλος της στην παθογένεια δεν είναι διασαφηνισμένος. Σε μία μελέτη από το Πανεπιστήμιο του Stanford, ερευνητές έδειξαν ότι ο ιός μολύνει και επαναπρογραμματίζει τα αυτοδραστικά Β λεμφοκύτταρα, οδηγώντας στην εκδήλωση του αυτοάνοσου.